MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Lactobacillus reuteri SD2112 plasmid pLR580

Total Repeats: 77

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015699	TTA	2	6	158	163	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015699	ATA	2	6	207	212	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015699	TCA	3	9	236	244	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_015699	TAT	2	6	324	329	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015699	TTA	2	6	395	400	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015699	TTC	2	6	425	430	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_015699	ATT	2	6	553	558	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015699	AAC	2	6	578	583	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_015699	CTT	2	6	673	678	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_015699	AAT	2	6	729	734	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_015699	CCGG	2	8	891	898	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12	NC_015699	ACCATT	2	12	922	933	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_015699	CAG	2	6	963	968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_015699	TAC	2	6	984	989	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_015699	CAA	2	6	990	995	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_015699	ACT	2	6	1060	1065	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_015699	TTG	2	6	1078	1083	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015699	CCG	2	6	1200	1205	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19	NC_015699	ACA	2	6	1247	1252	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_015699	TAA	2	6	1369	1374	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015699	ATTG	2	8	1378	1385	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015699	AT	3	6	1427	1432	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015699	TTTAAT	2	12	1468	1479	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015699	TCCC	2	8	1495	1502	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
25	NC_015699	TTA	2	6	1537	1542	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015699	CTA	2	6	1590	1595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_015699	TA	3	6	1594	1599	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015699	ATA	3	9	1597	1605	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015699	TAA	2	6	1616	1621	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015699	CACC	2	8	1633	1640	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
31	NC_015699	TAA	2	6	1687	1692	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015699	AGTTGA	2	12	1717	1728	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015699	T	7	7	1751	1757	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015699	ATC	2	6	1768	1773	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_015699	CT	3	6	1870	1875	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_015699	TAAAA	2	10	1908	1917	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015699	AAT	2	6	1918	1923	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015699	TCC	2	6	2483	2488	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
39	NC_015699	CCTG	2	8	2489	2496	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
40	NC_015699	ATA	2	6	2526	2531	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015699	TAAAA	2	10	2546	2555	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015699	ATA	2	6	2650	2655	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015699	A	6	6	2687	2692	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015699	GGAG	2	8	2756	2763	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015699	CT	3	6	2771	2776	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_015699	CCTC	2	8	2786	2793	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
47	NC_015699	CTGA	2	8	2808	2815	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
48	NC_015699	ATT	2	6	2850	2855	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015699	A	7	7	2928	2934	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015699	TCC	2	6	3532	3537	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
51	NC_015699	A	6	6	5569	5574	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015699	TCAC	2	8	5575	5582	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_015699	TAA	2	6	5593	5598	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_015699	AAG	2	6	5605	5610	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015699	TTA	2	6	5852	5857	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_015699	GGTT	2	8	6311	6318	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_015699	ATG	2	6	6370	6375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_015699	CAT	2	6	6389	6394	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_015699	AATT	2	8	6429	6436	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_015699	TCA	2	6	6446	6451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_015699	TCA	3	9	6455	6463	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_015699	CAT	2	6	6471	6476	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_015699	GAT	2	6	6483	6488	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_015699	ATT	2	6	6499	6504	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_015699	GAT	2	6	6572	6577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_015699	TTG	2	6	6593	6598	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_015699	AAG	2	6	6672	6677	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_015699	TCAA	2	8	6728	6735	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
69	NC_015699	CAT	3	9	6777	6785	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_015699	CTT	2	6	6787	6792	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_015699	CCA	2	6	6801	6806	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
72	NC_015699	TCA	2	6	6827	6832	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_015699	CAT	2	6	6840	6845	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_015699	TGG	2	6	6881	6886	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_015699	GTT	2	6	6941	6946	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_015699	GTA	2	6	6953	6958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_015699	TCT	2	6	6983	6988	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.